QE 赝势设置和 QEtoolkit 脚本设置和使用教程

1.赝势设置

QE常用赝势：GBRV-USPP-PBE，PAW-PBE
GBRV-USPP赝势下载地址
PAW-PBE赝势下载地址
在下载好上述赝势之后，然后在服务器上创立两个文件夹，然后把相对应的赝势放进对应的文件夹下。

2.QEtoolkit 脚本设置

• 脚本下载：首先在这个大佬的 博客 里面下载 QEtoolkit.sh 文件，然后把脚本上传至超算服务器。执行 dos2unix QEtoolkit.sh 和 chmod +x QEtoolkit.sh 使其成为可执行文件。
• 安装脚本所需环境：脚本使用需要具备 Multiwfn 程序。下载好 Multiwfn_3.8_dev_bin_Linux.zip 文件，上传超算服务器，进行解压：unzip Multiwfn_3.8_dev_bin_Linux.zip。之后在 .bashrc 文件中设置好环境变量，最后 source ~/.bashrc 即可。

注：上述环境变量执行后需进入 Multiwfn 安装文件夹下，执行 chmod +x Multiwfn，使 Multiwfn成为可执行文件。

• 脚本初始化设置：打开脚本，将脚本的赝势路径和 QE 版本设置成自己实际的路径和版本。

3.QEtoolkit 使用方法

QEtoolkit 的功能在于实现像 Multiwfn 快速生成 CP2K 的输入文件一样快速生成 QE 的输入文件。

• 坐标文件的准备：计算的结构坐标文件用 VESTA 生成的 POSCAR 文件，或者直接用 cif 文件。将 POSCAR 或 cif 放进对应计算任务文件夹下，进入计算文件夹下，执行 QEtoolkit.sh 脚本即可。之后会产生下图界面。选择对应的序号进行对应的计算任务，之后输入 POSCAR 或 cif 文件名就能进行坐标文件的读取并生成对应的 QE 计算输入文件。生成的 QE 计算的输入文件的内容是包含这个 POSCAR 或 cif 的坐标文件的。即完成简单的坐标读取和写入计算输入文件。

• 根据结构优化的输出文件 output 输出 .cif 文件：用法必须按照 QEtoolkit output文件名 进入页面然后选择输出想要的输出文件，不然直接输入 QEtoolkit 进入界面输出的只能是 .cif 式的隐藏文件。此外，该功能的应用，必须是在计算任务正常结束的情况下才能使用。