Linux 上安装 Gaussian

安装 Gaussian 前保证服务器已经安装好 oneapi

1.上传并解压安装包

• 首先上传 Gaussian 安装包 G16-C01-AVX.tbJ 上传至服务器，这里用的是 G16 的 01 版本

• 使用 tar -xvf G16-C01-AVX.tbJ 进行解压，解压之后会出现一个 g16 的文件夹，并且出现很多以 .exe 结尾的 Gaussian 计算模块

2.建立临时计算文件夹

• 建立一个文件夹用于储存 Gaussian 运行过程中产生的临时文件，位置随意。比如此例我们建立 /root/software/g16/scratch

4.配置环境变量

• vi .bashrc 输入：

export g16root=/root/softwareexport GAUSS_SCRDIR=/root/software/g16/scratchsource /root/software/g16/bsd/g16.profile

其中，g16root 环境变量用来说明 Gaussian 目录被放在了哪个目录下。GAUSS_SCRDIR 环境变量用来说明哪个文件夹作为临时文件夹。source 命令用来执行 Gaussian 自带的脚本文件，其中包含了各种配置 Gaussian 运行环境的命令。

• Gaussian 目录下的 Default.Route 用来设定默认用的计算资源（如果没有此文件就新建一个），-M- 设置默认用的最大内存量（一般用 MB 或 GB 为单位，也可以用 MW 和 GW，1MW = 8MB、1GW = 8GB），-P- 设置默认用多少 CPU 核数来并行计算。比如我们想默认用 2 个核心、最大 4GB 内存做计算，就在 /root/software/g16/Default.Route 里面写入以下内容：

-M- 4GB-P- 2

• 最后，切换到 /root/software/g16 目录，运行 chmod 750 -R * 命令，之后 Gaussian 就可以使用了。这里 -R * 代表对当前目录下所有文件和所有子目录下的文件都设置权限。

友情提示：默认情况下，当 Gaussian 任务运行中途中断，在 GAUSS_SCRDIR 环境变量设的临时文件夹里就会残留当前运行时生成的临时文件，文件名是任务的 pid 号。日积月累，可能此目录下的残留的临时文件体积会巨大，把硬盘占满，导致之后的各种 Gaussian 任务运行一开始就失败。因此，建议定期把临时文件夹里的内容清空，但不要在有任务运行的时候清理（或者，至少清理的时候别清掉当前任务对应的临时文件。用 top 或 ps 命令可以查看 pid 号）。

5.提交和取消任务

• 提交 Gaussian 任务：

• 取消任务：pkill -9 -f g16